Analyze NAMD and Amber MD trajectories with Gromacs 4.5
** 原文地址 编译gmx-4.6.5编译不成功,4.5.7可以,5.*并未测试 ... :( **
GMX在其编译时可选择 link to VMD libraries,进而利用vmd读取轨迹文件,故不需再进行轨迹的格式转换。
** by Nan **
本教程面向对LaTeX完全无认知无基础的新人。
** LaTeX软件的安装和使用 **
写完之后再检查一遍错别字(当然自己是找不到的),发现写的挺压抑挺黑暗,哈哈
下午来实验室刷知乎刷了半天,计划晚上分析一下最近的计算结果。可是吃完晚饭再回来却没有任何学习的劲头。那就趁着现在为近期的科研工作做个小总结。
本文内容摘抄或翻译自AMBER手册或教程,为本人学习AMBER时的笔记,如有侵权请联系删除。
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今天是中秋节,在宿舍宅了一天,并没有做什么有意义的事情。 相比以往,这应该是最冷清的一次中秋。已经记不清上一次在家过中秋是什么情景,只记得小时候每逢中秋节,会帮家里去街上卖东西,感觉很忙,并不是一件令人开心的事。时至今日,每每回想起那些情景,应当算是生命中极其幸福的时光。 那时候,过年前在家里帮忙,会觉得从年底到过年是段很漫长的日子,尤其在天气不好时。如今长大后,年底回家帮忙,一两周的时间似乎在转眼之间就过去了,这段时间里不用想学业、不用操心其它事情,成了每年中最安逸的一段时间。 也许,人就是这样。曾经喜欢的事物后来会变得讨厌,曾经嗤之以鼻的东西也有可能变成以后的心爱之物。曾经的当局者自认为难以承受的压力,在若干年后会变得轻如鸿毛。谁又能说得准现在经历的这些人这些事,在十年二十年之后的自己看来又是一番怎样的光景?
原文地址 ## 写在前面: ##
我是在ubuntu上面进行操作的,所以和原文有一点不同的地方,具体如下。
apache2为自行编译,版本为httpd-2.4.23.
./configure --prefix=/path/to/install --with-apr=/usr/local/apr --with-apr-util=/usr/local/apr-util/ --with-pcre=/usr/local/pcre (除了指定Apache的安装目录外,还要安装apr、apr-util、pcre,并指定参数)
make
make install
http://apr.apache.org/download.cgi 下载apr-1.4.5.tar.gz、apr-util-1.3.12.tar.gz http://sourceforge.net/projects/pcre/files/latest/download 下载pcre-8.35.zip (不要下载pcre2)